1082年，拜占庭给予威尼斯广泛的贸易让步，使得拜占庭的经济与财政制度、政府对帝国境内外国人活动的监督第一次遭到重要的破坏。从此，威尼斯人以及后来的比萨人和热那亚人经常以1082年的特权为先例，要求进一步的特权。
但拜占庭的官员们坚持对威尼斯商人行使一定的控制权。1082年特权规定无权过问威尼斯人的拜占庭官员中，不包括外交部长，外交部长负责检查威尼斯人船只，核查他们的身份以确保只有威尼斯人受益于他们所取得的特权1126年前，拜占庭对威尼斯人的贸易合伙人征税，这证实拜占庭确实对威尼斯人行使了这一监督权。在约翰·金那莫斯和 尼 克 塔 斯 · 侯 尼 雅 迪 斯关于曼努埃尔下令逮捕境内威尼斯人事件的记载中都没有表明威尼斯人“处于拜占庭政府当局的直接控制之外”。因此，拜占庭授予威尼斯人的特权并没有像安娜·科穆宁娜所说那样使威尼斯人“完全不受罗马人政府当局控制”。威尼斯在拜占庭的商业贸易扩张经常遭到阻碍。
第一，拜占庭授予威尼斯人的特权，经常被拜占庭政府拒绝承认或剥夺。约翰二世上台后拒绝批准阿莱克修斯一世授予威尼斯人的特权，威尼斯人侵入拜占庭迫使约翰认可并扩大他们的特权。曼努埃尔一世继位后也拒绝批准威尼斯人的特权，直到诺曼人西西里入侵，曼努埃尔为获得威尼斯海军援助，才不得不批准并扩大威尼斯人的特权。1171年3月12日，曼努埃尔下令逮捕境内所有威尼斯人并没收其财产，打断了威尼斯在拜占庭的贸易扩张。威尼斯人再次侵略拜占庭，企图以武力迫使拜占庭恢复威尼斯人特权、赔偿威尼斯人损失。但这时的拜占庭强大，威尼斯不是对手，拜占庭对威尼斯人的赔偿要求置之不理。直到威尼斯与西西里结盟，曼努埃尔甚为忧虑，这才答应恢复威尼斯人的特权地位，并答应为事件分期赔偿威尼斯损失费1500磅黄金。1171年事件后，威尼斯人大多到1183年秋以后才能够重新在拜占庭立足。直到1187年2月，威尼斯和拜占庭才重新开始正式的关系和恢复以前的协议，但双方协商的拜占庭赔偿威尼斯人在事件中所受损失却迟迟得不到兑现。后来，在安德罗尼库斯一世和依沙克二世统治期间，对此问题又进行了协商，到阿莱克修斯三世统治期间，拜占庭还欠着威尼斯$$ 磅黄金，并且阿莱克修斯拒绝偿还。
第二，拜占庭一度限制威尼斯对丝织品的贸易权。原则上威尼斯拥有所有商品的贸易自由，但拜占庭一度禁止威尼斯人从事底比斯生产的某些贵重丝织品的贸易，只是在1171年之前他们才获得底比斯丝织品的贸易权，但紫色丝织品除外。直到1195年，帝国对底比斯丝织品的生产和贸易仍保持着强有力的控制
第三，拜占庭官员的任意行动，特别是在地方，有时严重影响到威尼斯人享有特权的落实。帝国的关税官员有时任意征收过多税收、没收货物或者强求过境商人再次缴纳百分之十的商品税，尽管这笔费用已在出发港口缴纳了他们甚至无视皇帝禁止他们这样行事和命令他们作出赔偿的指示。
大约在1136年，威尼斯请求约翰二世指示他的官员们，保证威尼斯人在克里特和塞浦路斯的贸易自由和充分的免税权，以及把商品从克里特和塞浦路斯运到帝国其他地方的自由。约翰在1136年颁布的命令直到1147年都没有得到严格实施，结果，威尼斯在这些岛屿的贸易仍然受阻。
第四，其他意大利人的竞争。拜占庭在授予威尼斯人特权后，又先后授予比萨人和热那亚人特权。虽然授予比萨人与热那亚人的并非威尼斯人享有的完全免税权，只是部分免税权，但这并没有阻止他们的不断竞争。1192年，拜占庭先后授予比萨人和热那亚人特权，将其4%的税率从君士坦丁堡扩展到帝国各地，把4%的税率从原来仅限于进口商品扩大到他们在帝国境内的各种交易。这大大加剧了他们之间的竞争。此外，拜占庭统治者有意促使他们相斗。1162年，威尼斯人和比萨人进攻君士坦丁堡新建立的热那亚人区。据约翰·金那莫斯记载，1170年，威尼斯人攻击热那亚人；据尼克塔斯·侯尼雅迪斯记载，威尼斯人与比萨人有时在君士坦丁堡城中、有时在海上交战。
第五，第五，拜占庭人的仇视。威尼斯、热那亚和比萨在拜占庭享有特权，势力得到迅速发展，引起拜占庭人的不满和仇恨。据约翰·金那莫斯记载，威尼斯人因享受特权在拜占庭得到迅速发展，而对拜占庭人傲慢无礼，甚至皇帝的血亲也受到他们的轻蔑，引起拜占庭人的不满。1180年后，拜占庭人越来越仇视拉丁人，君士坦丁堡民众曾多次攻击城中的拉丁人。1182年，安德罗尼库斯发动君士坦丁堡民众袭击城中的拉丁人。当时受害的主要是热那亚人和比萨人。1187年“凯撒”康拉德帮依沙克二世布兰纳斯叛乱后，率拉丁人的军队进行劫掠，引起了君士坦丁堡工匠们的自发还击，他们没有武装，却敢与全副武装的拉丁人进行战斗，最后只是在拉丁人偷偷给被打死的拜占庭人换上拉丁人服装、剪短死者的头发，使工匠们误以为这些尸体是拉丁人的情况下，工匠们才停止战斗。
第六，12世纪末的拜占庭海盗猖獗。自1182年君士坦丁堡发生拉丁人大屠杀以来，比萨人和热那亚人为报复拜占庭人，趁拜占庭海军虚弱，在拜占庭水域大肆进行海盗活动，这严重恶化了拜占庭的贸易环境。
这些海盗看起来是商人，但一上岸就进攻、劫掠沿海地区。1191年，法王菲利普·奥古斯特和英王狮心理查的舰队前往圣地经过爱琴海时，那里的海盗已很猖獗。依沙克二世分别向比萨、热那亚提出抗议，得到的答复是政府无法控制海盗的个人活动。拜占庭皇帝无法控制海盗活动，不得不雇佣海盗来对付海盗。据尼克塔斯·侯尼雅迪斯记载，阿莱克修斯三世曾派卡拉布里亚海盗斯得瑞欧内斯率军攻打热那亚人海盗盖福瑞欧。1201年，当阿莱克修斯听说一支西西里海盗舰队进入拜占庭水域后，他雇佣了一个热那亚海盗去搜寻这支舰队。阿莱克修斯三世还因国库空虚不得不参与海盗活动。据尼克塔斯·侯尼雅迪斯记载，阿莱克修斯三世曾派君士坦丁·弗朗格普罗斯率 7 艘船到黑海劫掠商人，沿途抢劫了所有商人及其船上的货物。海盗猖獗破坏了拜占庭海域的秩序，恶化了拜占庭的经商环境。受海盗活动损害最大的是威尼斯人，因为他们在拜占庭帝国仍然拥有最大的商业利益。为了遏制比萨人的海盗劫掠活动，威尼斯甚至派舰队远至达达尼尔海峡入口处的阿拜多斯。
特权往往得不到落实、赔款得不到偿清、贸易受限制、比萨人和热那亚人竞争、海盗活动猖獗、拜占庭人仇视，所有这些都阻碍了威尼斯人在拜占庭的商业扩张，特别是海盗猖獗，恶化了拜占庭经商环境，威尼斯人即使享受特权，利益也难以得到保障。到1195年阿莱克修斯三世上台后，这种阻碍已经令威尼斯人难以忍受。尼克塔斯·侯尼雅迪斯指出，阿莱克修斯三世不仅创造新的税收来榨取拜占庭人城市，也向这些城市中的拉丁人征税。他往往不尊重同威尼斯人签订的条约，诈骗他们的钱财，对他们的船只征税，煽动比萨人反对他们。威尼斯人不能忍受拜占庭保证给自己的利益给了比萨人。他们在逐渐反对拜占庭人，等待合适的时机结清宿怨。而且，阿莱克修斯吝啬地拒绝给他们200磅黄金。当初曼努埃尔逮捕威尼斯人并没收他们的钱财，后来，曼努埃尔答应赔偿他们 1500磅黄金，这200磅黄金便是其中拜占庭仍欠着他们没还清的钱。
在这种情况下，威尼斯和拜占庭进行谈判协商。经过频繁接触和反复协商，最终阿莱克修斯在 1198年11月颁布加盖金印的法令，免除拜占庭境内威尼斯人的所有商业税，为避免出现漏洞，还详细列出了威尼斯人通常贸易的地方和城市，警告地方官员、修道院地产的管家和皇家地产的管家不得干预威尼斯商人，禁止官员没收威尼斯人中无遗嘱死者的财产。还从法律上给予威尼斯人一定的保护，规定涉及金钱的诉讼由被告的法庭负责对被告进行审判，涉及谋杀和公共秩序的诉讼由拜占庭法庭负责审判。这样，威尼斯人在拜占庭的特权得到恢复和扩大，他们在拜占庭境内的贸易扩张重新取得优势。
然而，实际情况并没有因为这一法令的颁布而得到大的改变。阿莱克修斯三世往往不尊重法令，官员们仍然任意行动。按照法令规定，威尼斯人在拜占庭的贸易虽取得了支配地位，但实际上在拜占庭市场中占优势地位的是比萨人。1199年，比萨人从阿莱克修斯那里取得新的特权，包括在君士坦丁堡获得一个新的码头。在1201年两个比萨人帮助依沙克的儿子阿莱克修斯逃到西方后，阿莱克修斯三世把恩惠转移给了热那亚人。在这种情况下，12世纪末威尼斯人企图征服拜占庭为其商业贸易扩张扫除障碍也就不足为奇了，他们的征服野心因当时拜占庭衰落、内乱而进一步膨胀，并在第四次十字军东征中最终得以实现。
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